Tahun 2012 Pengembangan Program Studi Keperawatan menjadi Fakultas Ilmu Keperawatan FIK
Tahun 2017 Berdiri Program Studi S1 Gizi dan S1 Bidan
Tahun 2018 Pengembangan Program Studi Kesehatan Masyarakat menjadi Fakultas Kesehatan Masyarakat
Sejarah Singkat Fakultas Kedokteran dan Kesehatan
Secara khusus, sejarah Fakultas Kedokteran dan Kesehatan dimulai pada tahun 1996 dengan nama Fakultas Kesehatan Masyarakat yang salah satu program studinya. Pada tahun 1998, berdasarkan pertimbangan Ketua Umum Muhammadiyah tentang Peraturan Pendidikan Tinggi, Diploma Keperawatan bergabung dengan fakultas karena memperluas program studi lain selain kesehatan masyarakat. Pada tahun 2001, nama fakultas tersebut berubah menjadi Fakultas Ilmu Kesehatan yang disusul dengan dibukanya program studi baru yaitu Program Studi Keperawatan.
Pada tahun 2001, berawal dari semangat Prof. Dr. Muhammadi selaku Rektor UMJ periode 1998-2002, terbentuklah tim yang luar biasa sebagai panitia persaingan Prodi Kedokteran. Tim ini terdiri dari beberapa praktisi, dosen profesional, dan staf ahli dari Program Studi Kesehatan Masyarakat. Setelah melalui proses yang luar biasa selama 3 tahun, akhirnya terbentuklah Program Studi Kedokteran pada bulan September 2003 yang mendapat persetujuan dari Menteri Pendidikan Tinggi Republik Indonesia. Akhirnya Fakultas Ilmu Kesehatan berganti nama menjadi Fakultas Kedokteran dan Kesehatan.
Secara berkelanjutan hingga tahun 2007, Fakultas Kedokteran dan Kesehatan mempunyai empat program studi. Yaitu Program Studi Kesehatan Masyarakat, Program Studi Kedokteran, Program Studi Ilmu Keperawatan, dan Program Studi Diploma Keperawatan. Pada akhir tahun 2007, berdasarkan peraturan dari Direktur Rumah Sakit Islam Jakarta, Cempaka Putih, dengan tujuan untuk mengembangkan Program Studi Diploma Kebidanan, maka penyelenggaraan penelitian ini diserahkan kepada Fakultas Kedokteran dan Kesehatan. Pada akhirnya, jumlah program studi di fakultas ini bertambah menjadi lima program studi.
Pada bulan April 2013, Program Studi Ilmu Keperawatan berkembang menjadi Fakultas Ilmu Keperawatan sesuai dengan Statuta Rektor Universitas Muhammadiyah Jakarta Nomor : 194 Tahun 2013. Tujuan utama dari pembenahan ini adalah untuk memenuhi kebutuhan sosial dan kemasyarakatan. Selain itu, permintaan tenaga profesional di sektor pembibitan semakin meningkat. Apalagi pada tahun 2014, sesuai Statuta Rektor, program pasca sarjana kesehatan masyarakat diserahkan ke Fakultas Kedokteran dan Kesehatan karena adanya kesamaan ilmu. Sebagai tujuan untuk memajukan ilmu pengetahuan dan keterampilan di bidang kesehatan masyarakat. Oleh karena itu, hingga pertengahan tahun ini hingga saat ini, Fakultas Kedokteran dan Kesehatan telah memiliki empat program studi.
Kegiatan perkuliahan pokok bidang kedokteran dan kesehatan masyarakat bertempat di kampus “A” yang beralamat di Jl. KH. Ahmad Dahlan, Cirendeu-Ciputat. Sedangkan kegiatan akademik kebidanan dipusatkan di Kampus “B” yang terletak di Jl. Cempaka Putih Tengah I/I, Jakarta Pusat. Selain itu, Program Studi Kedokteran juga memiliki kampus lain di Cempaka Putih untuk memenuhi kebutuhan di wilayah Jakarta.